Časopisi Naučni časopisi fakulteta Filomat (suizdavač Univerzitet u Nišu) Functional Analysis, Approximation and Computation (suizdavač Univerzitet u Nišu) Serbian Journal of Geosciences Biologica Nyssana (suizdavač Univerzitet u Nišu) Chemia Naissensis Applied Mathematics and Computer Science Journal of Functional and Stochastic Analysis Naučno popularni časopis Fakulteta Matematika i informatika Prirodno-matematički fakultet u Nišu je suizdavač sledećih naučnih časopisa: FACTA UNIVERSITATIS, Series Mathematics and Informatics (izdavač Univerzitet u Nišu) FACTA UNIVERSITATIS, Series Physics, Chemistry and Technology (izdavač Univerzitet u Nišu) Glasnik Antroploškog društva Srbije (izdavač Antropološko društvo Srbije)